不飽和ラムノガラクツロニル加水分解酵素の酵素活性測定

Creative Enzymesは、高品質なバイオアナリティカルサービスのリーディングカンパニーです。当社は、不飽和ラムノガラクツロニル加水分解酵素に対する分光光度法による活性アッセイなど、酵素活性測定に特化した個別対応の受託研究（CRO）サービスを提供しています。本酵素は近年発見・同定されたばかりであるため、速度論的挙動および構造を検討した研究は限られています。これらの情報が不足している状況下では、適切な活性測定は一層困難となります。しかし、Creative Enzymesは自社の高度な専門チームを基盤に、顧客要求を満たす堅牢な活性解析系を開発しました。

不飽和ラムノガラクツロニル加水分解酵素（EC 3.2.1.172、YesR）は、近年Bacillus subtilisから同定され、酵素学的特性に基づき新規の糖質加水分解酵素ファミリー105（GH-105）に分類されました。YesRは不飽和ラムノガラクツロナン（RG）に特異的に作用し、基質からΔGalAを生成します。本酵素は細菌および真菌に保存されている可能性が示唆されていますが、三次元構造は未解明のままです。

ラムノガラクツロナン（RG）は、植物細胞壁を構成する最も複雑な多糖であるペクチンの分岐領域に類似しています。植物細胞壁は、細胞形状の維持、栄養輸送、毒素および代謝産物の排出、ならびに微生物病原体からの防御において重要な役割を担います。植物細胞壁分解酵素は、微生物病原体が植物細胞へ侵入するうえで不可欠です。多くの植物病原性細菌は、ラムノガラクツロナンの主鎖であるRG-Iの分解を担う酵素を産生します。植物病原体の代表例である腸内細菌Erwinia chrysanthemiは軟腐病を引き起こし、不飽和ラムノガラクツロニル加水分解酵素を含む、RG-I関連酵素の複数タイプを産生します。不飽和ラムノガラクツロニル加水分解酵素はその特異的活性により、食品加工、バイオマス利活用、農業分野における触媒として、または植物病原体対策の標的として大きな可能性を有しています。そのため、本酵素の市場は今後急速に拡大することが見込まれます。しかしながら、本酵素に対する標準的な活性アッセイは確立されていません。

図1：YteRの提案触媒反応機構。
参考文献：Itoh T, Ochiai A, Mikami B, et al. Biochemical and biophysical research communications, 2006, 347(4): 1021-1029.

Creative Enzymesは、不飽和ラムノガラクツロニル加水分解酵素に対する高精度な酵素活性アッセイを提供できることを誇りとしています。本酵素活性は、235 nmにおける吸光度低下をモニタリングすることで測定します。これは基質のC=C二重結合の消失に対応します。当社の試験結果は、長年にわたりサービスをご利用いただいている数千社のお客様から高い信頼を得ています。研究開発における長年の実績により、Creative Enzymesは豊富な経験を蓄積し、酵素活性測定における第一選択として選ばれています。

図2：Bacillus subtilis由来YteRタンパク質の結晶構造。
PDB：1NC5