メカニズムモデリングと調査

コンピュータ支援メカニズムモデリングは、補因子と基質の触媒結合ポケットを定義することによって、酵素の特定の触媒メカニズムを研究するために分子シミュレーションを使用します。特定のタンパク質の構造的特徴をモデリングし導出することから、同じファミリーのタンパク質の分子メカニズムと機能的保存を徹底的に分析することができます。この研究の利点は、貴重な製造プロセスのために新しい活性と独自の特異性を持つ特定のバイオカタリストをターゲットにし、エンジニアリングすることを可能にします。

さまざまなアルゴリズム、ソフトウェア、およびデータベースが、ドメインアーキテクチャ分析、二次構造予測、ホモロジーモデリング、タンパク質ドッキングプロセス、クラスタリング分析など、異なる側面の分子モデリングのために開発されています。一般的に、メカニズムモデリングは、(i) ターゲットバイオカタリストの構造と特性の理解、(ii) ターゲットバイオカタリストとそのファミリーメンバーの構造の類似点と相違点、(iii) 多型の影響、(iv) 補因子と基質の認識および相互作用のためのターゲットタンパク質の基質結合ポケットの分子環境、(v) 触媒メカニズムモデリング、(vi) 新しい活性化合物を生成するためのバイオ合成調整酵素反応のエンジニアリングの構造的および分子的基盤、(vii) エピトープの分子変動性の影響に関する包括的な理解を提供します。

Creative Enzymes は、触媒メカニズムの研究やターゲットバイオカタリストの他の特性評価のためのコンピュータ支援分子設計を提供します。私たちの高度なアルゴリズムとデータベースによって可能になった、プロフェッショナルなワンストップサービスを提供します。

• タンパク質の構造的特徴モデリング。
• 結合ポケットモデリング。
• 触媒メカニズムモデリング。
• エンジニアリング戦略の設計。
• ソフトウェア開発。