酵素スクリーニングに基づくタンパク質間相互作用

タンパク質相互作用に基づく酵素スクリーニングについて

細胞生命は本質的に、タンパク質、核酸、および低分子間における分子相互作用ネットワークの継続に依存しています。相互作用の異常は、がんや自己免疫など多くのヒト疾患の主因となることが一般的です。タンパク質は単独で機能することは稀で、その機能は制御される傾向があるため、酵素、DNA、RNA、その他の低分子など多様な生体化合物とのタンパク質相互作用を解析することは、生化学的カスケードや疾患の分子病因の理解、ならびに潜在的なタンパク質標的の同定に資する知見を強化します。酵素探索においても、タンパク質相互作用の研究はスクリーニング手法の開発に寄与します。

生物個体内で生じるタンパク質相互作用の完全な地図はインタラクトームと呼ばれ、実験と計算の協働によってのみ達成可能です。タンパク質相互作用の代表的な実験手法には、酵母ツーハイブリッド（Y2H）法、アフィニティ精製と質量分析を組み合わせた手法（AP-MS）、および文献由来の低スループット実験があります。これらのアプローチは、相互作用の種類や特性を同定でき、ProtCIDや3DIDなど、既知のタンパク質界面に関する各種データベースの整備に貢献しています。一方、実験手法には限界があるため、タンパク質相互作用の計算機予測が必要となります。既存の計算アプローチの多くは、シミュレーションベース手法と統計／機械学習ベース手法に大別されます。タンパク質相互作用予測手法には、内部探索、遺伝子クラスターおよび遺伝子近傍、残基カップリング、ドッキング、遺伝子共発現プロファイルなどが含まれます。

目的に応じて、in vivo、in vitro、in silicoを含む各種のタンパク質相互作用解析手法をご提供可能です。

• 共免疫沈降（co-IP）、プルダウンアッセイ、クロスリンキングによるタンパク質相互作用解析、ラベル転移によるタンパク質相互作用解析、Far-Westernブロット解析など、タンパク質相互作用解析の実験手法。
• タンパク質相互作用解析の計算手法。
• プロテオームスケールのインタラクトーム研究。

当社のタンパク質相互作用に基づく酵素スクリーニングサービスには、以下が含まれます（これらに限定されません）。

• 標的タンパク質の選定および相互作用解析
• 基質およびリガンドのスクリーニング
• 酵素活性評価および特性解析
• 酵素の最適化および改変

当社サービスが選ばれる理由

• 豊富な実績：酵素学、構造生物学、計算化学、生化学の各分野にまたがる専門家チームを擁し、酵素技術領域における豊富な経験と専門性を有しています。
• カスタマイズ対応：お客様のニーズに応じたオーダーメイドの酵素スクリーニングソリューションを提供します。プロジェクトの目的、スケジュール、予算要件を丁寧に把握したうえで、要件に最適化したスクリーニング計画を設計します。
• 分野横断的な適用：当社の酵素スクリーニングサービスは、医薬品、農業、バイオテクノロジーなど幅広い領域に適用可能です。新薬開発、生産プロセスの最適化、既存酵素の性能向上など、目的に応じて有効なソリューションをご提供します。

Creative Enzymesは、高品質なタンパク質相互作用に基づく酵素スクリーニングサービスを提供するための先進技術と実績を有しています。サービスにご関心がある場合、またはご不明点がございましたら、どうぞお気軽にカスタマーサービスチームまでお問い合わせください。皆様と協働し、プロジェクトの成功を支援できることを楽しみにしております。

図1 タンパク質—タンパク質相互作用（PPI）予測手法の概念図。
（Chemical Reviews 2016）