ランダム変異導入およびDNAシャッフルのためのテンプレートDNAシーケンシング

正確で包括的な テンプレートDNAシーケンシング 成功した酵素工学プロジェクトの礎を形成する ランダム変異誘発とDNAシャッフル. で クリエイティブ酵素私たちは、変異原や再結合実験の前にテンプレートの整合性を確認し検証するために特別に設計された高精度DNAシーケンシングサービスを提供しています。

私たちのシーケンシングワークフローは、短い構造体にはサンガーシーケンシングを、より大きなまたは複雑なテンプレートには次世代シーケンシング（NGS）を組み合わせており、完全なカバレッジと信頼性の高い変異検出を確保しています。詳細な品質分析、汚染スクリーニング、エラー訂正を通じて、クライアントがランダム多様化のための堅牢な出発材料として機能する検証済みテンプレートを確立するのを支援します。

Creative Enzymesは、完全な配列確認とアライメント報告を提供することで、実験の不確実性を最小限に抑え、すべての成功した酵素工学キャンペーンの基盤となるDNAテンプレートの整合性を確保します。

背景：DNAテンプレートを使用したタンパク質工学プロジェクトの開始

ランダム突然変異とDNAシャッフル 遺伝的多様性の原則に依存する：科学者たちは、ランダムな変化を導入したり、関連する遺伝子の断片を再結合することによって、改良された酵素の変異体を発見するために広大な進化の風景を探求することができます。しかし、このプロセスは、信頼性があるのはその限りです。 開始DNAテンプレート。

未検証またはエラーの多いテンプレートは、アーティファクトを導入したり、誤解を招く結果を生じさせたり、さらにはミュータントのライブラリ全体を無効にする可能性があります。小さな配列のエラー、フレームシフト、またはプラスミドの誤アノテーションは、早期の切断、読み取りフレームの変化、または酵素活性と解釈可能性を損なう不要な変異を引き起こす可能性があります。

そのような問題を防ぐために、 テンプレートDNAシーケンシング これは重要な上流のステップです。これは、変異導入または組換えに使用されるDNA配列が意図された設計と正確に一致していること、そして不要な変異や汚染がないことを確認します。

クリエイティブエンザイムズでは、ランダム変異導入およびDNAシャッフルサービスのためのテンプレートDNAシーケンシングを提供しており、あなたのテンプレートDNAが科学的厳密さと文書による明確さで検証されていることを保証します。この基盤となる保証により、下流のライブラリ構築、発現、およびスクリーニングプロセスを通じて隠れた配列エラーが伝播するリスクが排除されます。

図1. DNAシャッフルの最初のステップは、酵素DNase Iを使用して親の配列をランダムに断片化することです。(Moore, 2002)

提供するもの：テンプレートDNAシーケンシング

私たちのテンプレートDNAシーケンシングサービスは、ランダム変異導入やDNAシャッフルのための出発材料に対する完全な信頼を提供するように設計されています。クライアント提供のプラスミド、PCR産物、または合成構造物を扱う場合でも、Creative Enzymesはすべての段階での正確性、再現性、およびトレーサビリティを保証します。

サービスワークフロー

サービスの特徴

問い合わせ

私たちのサービスを選ぶ理由

ケーススタディと成功事例

よくある質問

• Q: どのような種類のDNAテンプレートを配列決定できますか？

  A: プラスミド、PCR増幅産物、線状または環状DNA構造体を受け付けています。大きなまたは複雑なテンプレートの場合は、NGSを推奨します。

• Q: どのシーケンシングプラットフォームを選ぶべきですか—サンガー法それともNGS？

  A: サンガーシーケンシングは、短くてよく特徴付けられた遺伝子（<3 kb）に最適です。より大きな構造や超高精度を必要とするプロジェクトには、NGSが完全なカバレッジとバリアント検出を提供します。

• Q: シーケンシングの精度をどのように確保しますか？

  A: 我々は複数の重複したリードを実施し、内部コントロールを含め、結果を参照配列とクロスバリデーションします。すべてのデータは二重の手動および計算レビューを受けます。

• Q: プラスミドプール内の点変異や微小な汚染物質を検出できますか？

  A: はい。NGSは、0.1%の存在量までの低頻度変異体や汚染物質を検出でき、DNAシャッフルの前に親ライブラリを検証するのに理想的です。

• Q: シーケンシングで私のテンプレートにエラーがあることが判明したらどうなりますか？

  A: サイト特異的修復による配列修正を提供しています。 デノボ 合成。修正された構造は、正確性を確認するために再シーケンスされます。

• Q: シーケンシングと分析にはどのくらいの時間がかかりますか？

  A: 一般的なターンアラウンドタイムは、テンプレートの複雑さと選択したシーケンシング方法に応じて、5〜10営業日です。

• Q: 結果はどのように提供されますか？

  A: あなたは、生の配列データ、クロマトグラム、アラインメントレポート、注釈付きマップ、およびQCサマリーを受け取ります。オプションの物理的納品物には、検証済みのプラスミドDNAまたはグリセロールストックが含まれます。

• Q: 私の配列データは機密保持されていますか？

  A: はい。すべてのクライアント情報、シーケンス、結果は厳格な機密保持契約の下で保護されており、クライアントは完全な知的財産権を保持します。