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プロフェッショナルでコスト削減のソリューション

ランダム変異体の反応および発現条件の最適化

中で 酵素工学変異酵素の機能的な可能性は、その真の触媒および発現性能を明らかにする最適化された条件下でのみ完全に実現されます。 ランダム変異体の反応および発現条件の最適化 サービスで クリエイティブ酵素 酵素の収率と活性に影響を与えるすべてのパラメータを洗練させるように設計されており、発見と産業実装のギャップを埋めています。

系統的かつデータ駆動型の最適化を通じて、タンパク質発現効率と反応性能の両方を向上させ、進化したバリアントが関連する運用環境下で最高のパフォーマンスを発揮することを保証します。私たちの専門家は、酵素の折りたたみ、溶解性、触媒作用、安定性を支配する条件の理想的な組み合わせを特定するために、組み合わせ設計、高スループット分析、統計モデルを用います。

このサービスは、有望な酵素候補をプロセス準備が整ったバイオ触媒に変換し、スケールアップ、産業統合、または詳細なメカニズム分析の準備を整えます。

反応および発現条件を最適化する理由

ランダム変異誘発とDNAシャッフル 広範な配列多様性を生成し、潜在的に改善されたまたは新しい特性を持つ酵素を生み出します。しかし、これらの変異体は、発現や触媒作用中に予測不可能な挙動を示すことがよくあります。内因性活性が向上した変異体であっても、最適でない条件下で発現したり、反応パラメータがその安定性や基質結合をサポートしない場合には、期待通りの性能を発揮しないことがあります。

表現の最適化 再組換えタンパク質の収量と品質を左右する細胞および生化学的環境に関するものです。温度、誘導タイミング、培地の組成、宿主株の選択などの要因は、溶解性や折りたたみに大きな影響を与えます。

Optimization service of reaction and expression conditions for random mutagenesis variants at Creative Enzymes

同様に、 反応最適化 触媒環境—pH、温度、基質濃度、イオン強度、補因子、溶媒—に焦点を当てており、これらはすべて酵素の性能を調整することができます。体系的な微調整がなければ、優れた変異体でさえ非活性または不安定に見えることがあります。

クリエイティブエンザイムズは、発現と反応の両方の次元を統合し、一貫した最適化フレームワークを構築しています。経験的な実験計画(DoE)、ハイスループットスクリーニング、そしてメカニスティックな解釈を用いて、すべての変異体酵素が最適な条件下で発現し、評価されることを保証します。

私たちが提供するもの

私たちは、酵素発現と反応性能に影響を与えるすべての変数をカバーする包括的な最適化サービスを提供しています。私たちのモジュール式アプローチは、プロジェクトのニーズに応じて、個々の突然変異体や全体の突然変異体パネルに適用できます。

カテゴリ サービス 価格
表現の最適化 宿主とベクターの選択原核生物および真核生物系の評価大腸菌ピチア・パストリスバチルス・サブチルスタンパク質の種類と翻訳後の要件に基づいて、昆虫細胞などを使用します。 問い合わせ
誘導パラメータの精緻化誘導剤の種類、濃度、タイミングの系統的変化による最大可溶性発現。
温度と文化条件の調整成長速度と折りたたみ効率のバランスを取るための栽培パラメータの調整。
メディアと添加物の最適化定義された媒体の調製と化学シャペロンを使用して溶解度を向上させる。
共発現戦略複雑なタンパク質のための折りたたみ補助因子や分子シャペロンの導入。
溶解度と収率分析SDS-PAGE、デンシトメトリー、および活性回復指標による定量評価。
反応条件の最適化 触媒パラメータの最適化pH、バッファー組成、イオン強度、および補因子濃度のファインチューニング。 問い合わせ
温度および溶媒耐性の研究運用範囲にわたる安定性プロファイルの決定。
基質および生成物の分析基質特異性と阻害動力学の評価。
実験計画法 (DoE)主要な変数と相互作用効果を特定するための統計モデル。
反応工学酵素性能データのスケーラブルなバイオリアクターまたは連続フロー形式への統合。
安定性および長寿命テスト産業的または生理的条件下での長期的な活動の評価。
統合データ分析と報告 状態とパフォーマンスの関係の定量的モデル化。 問い合わせ
最適な発現/反応ウィンドウの特定。
再現可能な下流の実装をサポートするためのグラフィカルおよび統計的要約。

サービスワークフロー

Service workflow of reaction and expression conditions optimization

サービスの特徴

  • 適用酵素すべてのクラス、酸化還元酵素、転移酵素、加水分解酵素、リアーゼ、異性化酵素、リガーゼを含む
  • 発現システム: 大腸菌ピチア・パストリスバチルス・サブチリス昆虫、または哺乳類細胞
  • 最適化手法実験計画法(DoE)、単因子スクリーニング、因子設計
  • スループット最適化サイクルごとにテストされる条件は50〜500です。
  • 分析技術UV/Vis分光光度法、蛍光測定法、HPLC、LC-MS、SDS-PAGE、動力学モデリング
  • 成果物最適化された発現プロトコル、最適化された反応条件、検証データ
  • ターンアラウンドタイム酵素の複雑さと最適化の範囲に応じて、4〜6週間です。
  • オプションの追加機能生産のスケールアップ、動的パラメータの決定、安定性プロファイリング

お問い合わせ

なぜ私たちを選ぶのか

包括的な二重最適化

発現と反応の調整を分けるプロバイダーとは異なり、私たちは酵素の収率と機能的性能を最大化するために、両方を一緒に最適化します。

メカニズム的および統計的洞察

生化学的推論は、データ駆動型のDOEモデルと組み合わされ、従来の単一変数手法では見逃されるパラメータ間の相互作用を明らかにします。

多用途でスケーラブルなシステム

私たちのワークフローは、マイクロプレートおよびバイオリアクター形式に適応し、研究からパイロットスケールへのスムーズな移行を確保します。

高スループット分析能力

自動化された表現および反応アッセイは、信頼性の高い精度で複雑なパラメータ空間の探索を加速します。

酵素の挙動にカスタマイズされた

各酵素と各変異体は異なる挙動を示します。私たちはすべての最適化実験をそれぞれの独自の動力学的および構造的特性に合わせて調整します。

エンドツーエンド統合

最適化された条件は、シームレスなエンジニアリングワークフローのために、精製、スクリーニング、およびスケールアップに直接フィードバックします。

ケーススタディと成功事例

ケース1:熱耐性エステラーゼ変異体の発現条件の最適化

クライアントのニーズ:

研究コンソーシアムは、ランダム変異導入を用いて一連の好熱性エステラーゼ変異体を進化させました。粗抽出物では有望な活性が見られたものの、可溶性発現レベルが低く、精製と分析が妨げられました。

私たちのアプローチ:

複数をスクリーニングしました 大腸菌 株とベクターシステム、誘導温度(37°Cから18°C)、IPTG濃度、および誘導後の期間を調整しました。因子設計アプローチにより、温度、誘導剤濃度、および培地の組成が収量に与える影響を評価しました。

結果:

最適な発現は、低いIPTG濃度と強化されたTB培地で20°Cで達成されました。可溶性収率は初期条件と比較して12倍以上増加し、精製された酵素は一貫した活性と熱安定性を示しました。

ケース2:ランダムに変異したオキシダーゼライブラリの反応最適化

クライアントのニーズ:

バイオテクノロジー企業は、触媒効率を向上させるためのオキシダーゼ変異体を生成しました。しかし、活性アッセイでは大きな変動が見られ、これはおそらく変異体間で反応条件が一貫していないことによるものです。

私たちのアプローチ:

pH(6.0–9.0)、温度(20–50°C)、および補因子(FAD)濃度を含む多変数最適化を実施しました。応答曲面法(RSM)を使用して、条件と触媒回転数を関連付ける予測モデルを構築しました。

結果:

最適化された反応環境(pH 7.8、37°C、0.5 mM FAD)は、触媒効率を4.3倍向上させ、バリアント間の再現性を改善しました。最適化されたパラメータは、その後、95%以上の基質変換を伴う調製スケールの合成に使用されました。

ケース3:変異トランスアミナーゼのための表現型と反応の最適化の統合

クライアントのニーズ:

製薬会社は、基質特異性が変化した変異トランスアミナーゼの発現と触媒活性の両方を最大化しようとしました。初期の試験では高い発現が見られましたが、活性は低く、折りたたみと反応条件が不適合であることを示唆しました。

私たちのアプローチ:

私たちは並行発現試験を実施しました。 大腸菌ピチア・パストリス 反応のpH、温度、共基質濃度を同時に最適化しながら、機械学習を用いたデータフィッティングにより、収率と回転数の両方に影響を与える相互依存変数が特定されました。

結果:

最終的な統合プロトコルは、可溶性酵素の収率を7倍向上させ、触媒効率を5.6倍増加させました。この酵素は、産業規模の非対称合成において実用的なバイオ触媒となり、統合的最適化の重要性を示しました。

よくある質問

  • このサービスから恩恵を受けるミュータントの種類は何ですか?

    A: ランダム突然変異やDNAシャッフルによって生成された任意の酵素変異体は、特に部分的または不一致な発現や触媒挙動を示すものにとって利益をもたらすことができます。
  • Q: 表現と反応条件の両方を同時に最適化できますか?

    A: はい。私たちのワークフローは、酵素と利用可能なデータに応じて、同時または逐次的な最適化を可能にします。
  • 最終報告書にはどの程度の詳細を提供しますか?

    A: クライアントは、生データ、グラフィカルモデル、最適化されたパラメータ、および実験の根拠を含む包括的な文書を受け取ります。
  • Q: 不溶性タンパク質はどのように扱いますか?

    A: 我々は、温度調整、添加剤スクリーニング、または代替発現系を含む溶解度向上戦略を採用しています。
  • Q: 高スループット法を用いて最適化を行うことはできますか?

    A: もちろんです。効率的な条件スクリーニングとデータ生成のために、96ウェルおよび384ウェルフォーマットを使用しています。
  • Q: 最適化された条件がスケーラブルであることをどのように保証しますか?

    A: すべての最適化された条件は、再現性とプロセスの安定性を確認するために、増加するスケールで検証されます。
  • Q: 最適化後に運動解析を提供しますか?

    A: はい。運動定数を決定することができます(KM、Vマックスk) および機能的改善を検証するための熱安定性。
  • このサービスは、あなたの変異誘発またはスクリーニングモジュールと互換性がありますか?

    A: 完全に。私たちの突然変異導入、アッセイ設計、ライブラリスクリーニングサービスと直接統合されています。
  • Q: 工業条件(例:溶剤、基板)を指定できますか?

    A: はい。特定の運用またはプロセス環境を模倣するように最適化実験を調整できます。
  • クライアントデータをどのように保護しますか?

    A: すべてのデータ、シーケンス、および結果はクライアントの専有財産であり、厳格な機密保持プロトコルの下で保護されています。

研究および産業用途にのみご使用ください。個人医療用途には適していません。一部の食品グレード製品は、食品および関連用途における処方開発に適しています。

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