自然バイオ触媒のサンプリングとスクリーニング

微生物は進化の過程で無数の基質や環境条件にさらされ、無限の代謝物や酵素活性を生み出してきました。したがって、特定の酵素活性を持つ環境サンプルから分離された多様な生物をスクリーニングすることで、新しい微生物バイオカタリストを特定するための時間をかける価値があります。自然界のほとんどの微生物はラボで培養できないため、DNAベースの培養に依存しないアプローチがバイオカタリスト発見の最前線となっています。これらの方法は、環境DNAからの発現ライブラリを特定の活性のためにスクリーニングするライブラリベースのスクリーニングに依存しています。

最新の技術は、(i) バクテリア細胞における商業的に興味深い酵素活性を特定するためのスクリーニング方法の開発、(ii) 自然のバイオカタリストを改善するためのアプローチ、(iii) 非従来型培地の開発に焦点を当てています。自然から興味のあるバイオカタリストを探すために、さまざまなメタゲノム戦略が開発されました。たとえば、既知のバイオカタリストに類似した酵素を探す配列ベースのメタゲノムアプローチや、既知の酵素の保存された領域に基づいて設計されたプライマーを使用するPCRベースの方法、または環境メタゲノムから直接クローン化されたDNAを使用してメタゲノムライブラリを構築しスクリーニングする機能的メタゲノミクスがあります。一方で、自然のバイオカタリストは、組換えDNA、代謝工学、組み合わせバイオ合成などの技術を用いて改善することができます。

Creative Enzymesは、カスタム要件に適した自然のバイオカタリストを選択するための高スループットスクリーニングおよび微生物学的技術を提供し、ターゲットを改善するための戦略も提供します。メタプロテオミクスに関する私たちの豊富な知識と広範なデータベースを活用して、プロフェッショナルなワンストップサービスを提供します。

• メタゲノム戦略の設計。
• 自然のバイオカタリストの高スループットスクリーニング。
• 自然のバイオカタリストの最適化。
• 代替の非従来型培養。

図1. 機能的メタプロテオミクスのワークフローの例
(Microbiome, 2017)