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代謝フラックス解析

代謝フラックス分析(MFA)は、バイオカタリシス開発の開始以来、経路工学の柱となっています。経路工学において、設計された経路が宿主株に導入されると、代謝フラックスはターゲット製品に向けて再配分される必要があります。この30年間で、さまざまなフラックス分析技術が開発され、単純な微生物から複雑な真核系に至るまで、広範な生物システムにおける細胞内代謝を解明するために適用されてきました。

異なる計算モデルに基づくさまざまなMFA手法は、(i) システムの代謝定常状態が仮定されているかどうか、(ii) 安定同位体トレーサーが適用されているかどうか、(iii) システムの同位体定常状態が仮定されているかどうかによって区別されます。これらのモデルは、フラックスバランス分析(FBA)などの化学量論モデルのみのモデルか、代謝経路と調節相互作用の動的挙動を捉える可能性がある動力学モデルです。その中でも、FBAは計算負荷が少ないため、ゲノムスケールなどの大規模モデルに広く使用されています。これは、仮定された細胞の目的関数(例:最大細胞成長)を満たすフラックス解空間を生成します。

私たちの代謝フラックス分析サービスは、最新の生物学、バイオインフォマティクス、ソフトウェア開発の知識によって実現されています。私たちは、クライアントが私たちのモデルに基づいてさまざまなシミュレーションを解決するのを支援します。私たちのフラックス分析は、原核系と真核系の両方におけるフラックスを定量化することを目指しています。

私たちは、すべての研究開発活動をサポートするために幅広いサービスを提供しています:

  • 代謝ネットワークの再構築。
  • 数学モデルの構築。
  • 目的の最適化。
  • ソフトウェア開発。

Classes of metabolic flux analysis 図1. フラックス分析アプローチのクラス
(現在の化学生物学の意見 2015)

References:

  1. Antoniewicz, M.R. (2015) Methods and advances in metabolic flux analysis: a mini-review. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 42: 317-325.
  2. Ng, C.Y., Khodayari, A., Chowdhury, A., Maranas, C.D. (2015) Advances in de novo strain design using integrated systems and synthetic biology tools. Current Opinion in Chemical Biology. 28: 105-114.

私たちの製品は、個人使用のために直接医薬品として使用することはできません。

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