真核細胞において、プロモーター上のTATAボックスは転写因子TFIIDと結合して安定した複合体を形成し、その後、他の転写因子（TFIIA、TFIIB、TFIIF、TFIIE、TFIIHなど）およびRNAポリメラーゼがDNAと結合して特定の配列を形成します。転写開始複合体です。転写開始複合体は転写を開始する「分子機械」です。TBP（TATA結合タンパク質）を含む転写因子がDNAと相互作用すると、他の因子も複合体を形成し、最終的にRNAポリメラーゼと結合して転写開始複合体が形成されます。

TAF1ファミリー

転写開始因子TFIIDサブユニット1は、転写開始因子TFIID 250 kDaサブユニット（TAFII-250）またはTBP関連因子250 kDa（p250）とも呼ばれ、ヒトではTAF1遺伝子によってコードされるタンパク質です。

図1. TAF1のタンパク質構造。

機能

RNAポリメラーゼIIによる転写開始には70種類以上のポリペプチドの活性が必要です。これらの活性を調整するタンパク質が基本転写因子TFIIDであり、コアプロモーターに結合してポリメラーゼを正確に位置決めし、他の転写複合体の組み立ての足場となり、調節シグナルの通路としても機能します。TFIIDはTATA結合タンパク質（TBP）と、TBP関連因子またはTAFと呼ばれる進化的に保存されたタンパク質群から構成されます。TAFは基礎転写に関与したり、共活性化因子として働いたり、プロモーター認識や一般転写因子（GTF）の修飾を通じて複合体の組み立てや転写開始を促進する役割を果たすことがあります。この遺伝子はTFIIDの最大サブユニットをコードしています。このサブユニットは転写開始点を含むコアプロモーター配列に結合します。また、活性化因子や他の転写調節因子とも結合し、これらの相互作用が転写開始速度に影響を与えます。このサブユニットはN末端およびC末端に2つの独立したプロテインキナーゼドメインを持ち、アセチルトランスフェラーゼ活性も有し、ユビキチン活性化/結合酵素としても機能します。この遺伝子には異なるアイソフォームをコードする2つの転写産物が同定されています。ヒストンはしばしばアセチル化されて転写のためにDNAが活性化されます。TAF1は2つのブロモドメインを持ち、それぞれがH4テールの5位および12位のアセチルリジン残基のいずれか1つと結合し、TBP-TATAボックス複合体を安定化させます。

臨床的意義

同定されたTAF1変異は、重度の知的障害（ID）、特徴的な股関節のしわ、広い鼻、垂れた頬、傾いた眼瞼下垂、突出した眼窩脊、見開いた目、相対的な硝子体肥大、薄い上唇、上顎のアーチ、突出した耳、螺旋の肥厚および顎先の突出など、独特の顔貌を伴う表現型を引き起こすことがあります。これはTAF1の非同義変異であり、1337番目のアミノ酸残基がスレオニン（極性）からイソロイシン（疎水性）に変化します。さらなる臨床的詳細は報告されていませんが、TAF1は知的障害を持つ2家系で他に2つの変異も報告されています。

TAF2

転写開始因子TFIIDサブユニット2は、ヒトのTAF2遺伝子によってコードされるタンパク質です。RNAポリメラーゼIIの転写開始には70種類以上のポリペプチドの活性が必要です。これらの活性を調整するタンパク質が転写因子IID（TFIID）であり、コアプロモーターに結合してポリメラーゼを正確に位置決めし、他の転写複合体の組み立ての足場となり、調節シグナルの通路としても機能します。TFIIDはTATA結合タンパク質（TBP）と、TBP関連因子またはTAFと呼ばれる進化的に保存されたタンパク質群から構成されます。TAFは基礎転写に関与したり、共活性化因子として働いたり、プロモーター認識や一般転写因子（GTF）の修飾を通じて複合体の組み立てや転写開始を促進する役割を果たすことがあります。この遺伝子はTFIID複合体の安定性に関与する大きなサブユニットの1つをコードしています。転写開始点およびその下流との相互作用を促進し、転写複合体の活性化因子への応答を決定するのに役立ちます。

参考文献:

1. Martinez E; 他。新規補因子およびTFIIAは、ヒトTAFII150含有TFIID複合体による機能的コアプロモーター選択性を媒介する。1998年。