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酵素反応速度論

酵素速度論は、各種要因によって影響を受ける酵素触媒反応の反応速度を解析する学問であり、酵素反応機構および機能の解明に極めて大きな可能性を提供します。酵素反応速度に影響を与える主な要因として、酵素濃度、リガンド(基質、生成物、阻害剤、活性化剤)濃度、溶媒条件(溶液組成、イオン強度、pH)、および温度が挙げられます。これらの要因を適切に解析することで、酵素の性質について多くの知見を得ることが可能です。リガンド濃度を変化させて酵素反応の速度論的検討を行うことにより、生化学反応の速度論的機構を理解するうえで不可欠な速度論パラメータが得られます。酵素速度論の検討は、当該酵素の触媒機構、代謝における役割、活性制御の様式、ならびに医薬品またはアゴニストが当該酵素をどのように阻害し得るかを明らかにします。

基質濃度の影響

多くの化学反応では、基質濃度の増加に伴い反応速度が増加します。単一基質の不可逆的酵素反応では、基質濃度が上昇すると酵素反応速度は増加し、最大値に漸近します。基質による反応の飽和現象に基づき、ドイツの生化学者レオノール・ミカエリスおよびカナダの医師モード・メンテンにより「中間生成物」説が提唱されました。すなわち、酵素(E)が基質(S)と結合して不安定な中間体または複合体(ES)を形成し、その後、生成物(P)と遊離酵素(E)を生じます。この理論から反応速度と基質濃度の関係が導出され、ミカエリス–メンテン式として知られています。

酵素濃度の影響

反応系における基質濃度が十分に高い場合、酵素反応速度は酵素濃度に比例します。反応中に存在する酵素量は、触媒する活性(酵素活性)として測定されます。活性と濃度の関係は、温度、pH等の多くの要因の影響を受けます。酵素濃度が唯一の律速因子となるよう、観測される活性が存在酵素量に比例する条件で酵素アッセイを設計する必要があります。

酵素阻害の影響

酵素の変性および失活を引き起こすことなく酵素反応速度を低下させ得る物質は、総称して酵素阻害剤と呼ばれます。阻害作用の様式により、不可逆阻害剤と可逆阻害剤の2種類に分類されます。不可逆阻害は、阻害剤が酵素の必須官能基と共有結合することにより生じ、透析等の簡便な方法では酵素活性を回復できません。可逆阻害は、阻害剤が酵素と非共有結合で結合することにより生じ、透析等の簡便な方法で酵素活性を回復できます。可逆阻害には、競合阻害、非競合阻害、および不競合阻害が含まれます。

温度の影響

一般に、酵素反応速度は温度の上昇に伴い増加しますが、温度が一定点を超えると、酵素の熱変性により反応速度は急速に低下します。酵素反応速度が最大となる温度を、当該酵素の至適温度と呼びます。酵素の至適温度は実験条件に依存するため、酵素固有の定数ではありません。

pHの影響

反応媒体中の水素イオン濃度も、酵素活性に大きく影響します。酵素はしばしば一定のpH範囲で最大活性を示し、最大活性を示すpHを当該酵素の至適pHと呼びます。至適pH範囲では酵素反応速度が最も高く、それ以外では酵素反応速度は低下します。

酵素は反応を「起こす」のではなく、起こる反応の速度を促進します。酵素存在下で進行する化学反応は、酵素が存在しなくても進行しますが、その速度は著しく遅くなります。酵素は反応の活性化エネルギーを低下させることで化学反応速度を触媒し、しかも反応物に対して高度に特異的な様式でこれを行います。酵素作用の研究の初期段階から、意義ある酵素作用の検討には、適切な酵素存在下における化学反応の速度論的挙動の解析が必須であることが認識されていました。現在でも、酵素触媒反応の速度論的挙動を理解すれば、酵素反応機構について多くを理解できるという点は変わりません。そのためには、厳密に規定された条件下で酵素反応の速度論的挙動を検討する必要があります。酵素の最も重要な速度論的特性は、特定の基質に対してどの程度容易に飽和に達するか、ならびに達成可能な最大反応速度です。これらの特性を把握することで、細胞内で酵素が果たし得る役割が示唆され、条件変化に対する酵素応答の予測にもつながります。

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