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研究、診断および産業用の酵素

カスタム酵素

Creative Enzymesによるカスタム酵素。

酵素は生物システムの触媒であり、研究や診断アプリケーションに不可欠な存在となっています。研究から診断に至るまで、これらの生体触媒は前例のない特異性と効率で広範な化学変換を触媒します。しかし、自然の酵素は常にその用途に完璧に適合するわけではありません。そこでカスタム酵素が登場し、自然の機能と実用的なニーズのギャップを埋めます。特定の仕様に合わせて修正または設計されたテーラーメイドの酵素は、複数の分野で変革の可能性を提供します。

Creative Enzymesでは、科学的発見を促進するだけでなく、診断、分子生物学、医療研究における革新の扉を開くために特定のニーズに合わせた高品質のカスタム設計酵素および酵素ブレンドを提供しています。

カスタム酵素の必要性

自然界は多様な酵素ツールキットを提供していますが、自然の酵素は研究、診断、または治療アプリケーションの厳しい要求を満たすことができないことがよくあります。熱的不安定性、pH感受性、最適でない基質特異性、低触媒効率などの要因が、非生物環境での性能を制限することがあります。カスタム酵素は、ターゲットを絞った修正を通じてこれらの欠点に対処し、性能を向上させながらアプリケーションの範囲を広げます。

カスタム酵素設計の戦略

カスタム酵素設計は、特定の機能目標を達成するために調整された複数の戦略を含みます。これらのアプローチは大きく次のように分類できます。

指向進化

構造的知識が限られている場合、指向進化は強力な代替手段を提供します。この方法は、ランダム変異や組換えを通じて酵素ライブラリを作成することで、実験室で自然選択を模倣します。変異体は望ましい特性のためにスクリーニングされ、最も優れたパフォーマーは変異と選択の反復サイクルを通じてさらに洗練されます。

指向進化は、持続可能なバイオ燃料生産、製薬合成、さらには新しいバイオマテリアルのための酵素を作成する上で重要な役割を果たしてきました。

合理的設計

合理的設計は、酵素の構造とメカニズムに関する詳細な知識に依存します。研究者は計算ツールと構造生物学技術を使用して、アミノ酸配列の変更が酵素の活性、安定性、または特異性にどのように影響するかを予測します。

例えば、活性部位に特定の変異を導入することで基質結合を改善し、触媒効率を向上させることができます。同様に、周辺領域の修正は、高温やその他の厳しい条件下での酵素の安定性を向上させることができます。

デ・ノボ設計

カスタム酵素を作成する最も野心的なアプローチはデ・ノボ設計であり、まったく新しい酵素をゼロから作成します。計算モデルを使用して、科学者は特定の反応に最適化されたカスタマイズされた活性部位を持つ酵素を設計します。この技術は挑戦的ですが、自然界では知られていない反応のための酵素を含むブレークスルーをもたらしました。

化学修飾

酵素をポリマー、補因子、またはナノ粒子と共役させるなどの化学修飾は、酵素の性能をさらに向上させることができます。これらの修飾は、熱安定性を改善したり、免疫原性を低下させたり(治療的文脈で)、または産業用途のために部位特異的固定化を可能にしたりします。

カスタム酵素設計の戦略:酵素の再設計、指向進化、半合理的設計、合理的設計、デ・ノボ設計。図1:酵素設計アプローチ。(a) 酵素のフィットネスランドスケープマップは、酵素の異なる変異体とそのフィットネスの関係を示します。(b) 指向進化は、ランダム変異、スクリーニング、選択の複数のラウンドを通じてタンパク質の機能を改善するために自然進化プロセスを模倣します。(c) 半合理的設計アプローチでは、酵素構造に基づいて特定された重要な部位が飽和変異導入によって変異され、酵素機能が改善されます。(d) 合理的設計アプローチでは、酵素の動的構造と触媒メカニズムに基づいて特定された部位が変異され、タンパク質機能が改善されます。(e) デ・ノボ設計手法は、ゼロからタンパク質の骨格を構築し、新しい機能を持つタンパク質構造を生成します。(Zhou and Huang, 2024)

カスタム酵素ブレンド

カスタム酵素ブレンドは、特定の機能を実行したり、望ましい結果を達成するために複数の酵素を戦略的に組み合わせたものを指します。個々の反応を触媒する単一の酵素とは異なり、酵素ブレンドは相乗的に機能するように設計されており、効率、機能性、汎用性を向上させます。

研究および診断目的のために、酵素ブレンドは特定の実験条件や診断要件を満たすために特異性、活性、安定性を最適化できます。これらのブレンドは、連続反応、多段階プロセス、または特定の基質との互換性を必要とするアプリケーションで特に価値があります。

研究および診断用途におけるカスタム酵素の応用

特定の要件を満たすように設計されたカスタム酵素は、そのテーラーメイドの活性、安定性、特異性により、研究および診断において非常に貴重です。これらの応用は、分子生物学、プロテオミクス、臨床診断、バイオテクノロジーなどの多様な分野にわたります。

分子生物学の応用

  • PCRおよびqPCR:修正されたDNAポリメラーゼは、ポリメラーゼ連鎖反応における増幅効率、忠実度、速度を向上させ、遺伝子型決定や遺伝子発現研究などの応用を可能にします。
  • 遺伝子編集:カスタムヌクレアーゼ(例:CRISPR関連酵素)は、正確なゲノム編集を可能にし、機能的ゲノミクスや治療研究を支援します。
  • クローニング:テーラーメイドの制限酵素やリガーゼは、ベクターデザインやDNA組み立て効率を向上させます。

プロテオミクスおよびタンパク質工学

  • タンパク質消化:特定の切断好みを持つ修正されたプロテアーゼは、ペプチドマッピングや質量分析を向上させます。
  • 翻訳後修飾分析:テーラーメイドのキナーゼ、ホスファターゼ、グリコシダーゼは、リン酸化や糖鎖付加などのタンパク質修飾の研究を可能にします。

臨床診断

  • バイオマーカー検出:ペルオキシダーゼやアルカリフォスファターゼなどの酵素は、信号生成と安定性を向上させるために、ELISAやラテラルフローテストを含む免疫測定にカスタマイズされています。
  • ポイントオブケアテスト:テーラーメイドの酵素は、感染症、代謝障害、心血管疾患の迅速診断テストの精度と速度を向上させます。
  • 核酸検出:カスタム逆転写酵素やポリメラーゼは、COVID-19検出や癌変異スクリーニングなどの診断アプリケーションにおいて感度を向上させます。

環境および食品検査

  • 病原体検出:迅速な増幅と検出のために設計された酵素は、食品由来の病原体や汚染物質の特定に使用されます。
  • 残留物分析:テーラーメイドの酵素は、食品や環境サンプル中の農薬、抗生物質、アレルゲンの検出を支援します。

研究ツールの開発

  • バイオセンサー:高い特異性と安定性のために設計された酵素は、代謝物、イオン、環境汚染物質を検出するためにバイオセンサーに組み込まれます。
  • 信号増幅:カスタマイズされた酵素は、蛍光、比色、または化学発光アッセイにおける感度を向上させ、研究やハイスループットスクリーニングにおいてより堅牢にします。

研究および診断分野におけるカスタム酵素の応用。

カスタム酵素は、比類のない精度、効率、柔軟性を提供することで、研究と診断を革新しました。Creative Enzymesでは、特定のニーズに応じた専門的に設計されたカスタム酵素を提供しています。今すぐお問い合わせいただき、研究および診断アプリケーションに最適なソリューションを見つけてください!

Reference:

  1. Zhou J, Huang M. Navigating the landscape of enzyme design: from molecular simulations to machine learning. Chem Soc Rev. 2024;53(16):8202-8239.
カタログ 製品名 EC番号。 CAS番号 ソース 価格
EXWM-1921 25S rRNA (ウラシル2634-N3)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.313 お問い合わせ
EXWM-1920 25S rRNA (ウラシル2843-N3)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.312 お問い合わせ
EXWM-1919 25S rRNA (シトシン2278-C5)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.311 お問い合わせ
EXWM-1918 25S rRNA (シトシン2870-C5)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.310 お問い合わせ
EXWM-1917 18S rRNA (グアニン1575-N7)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.309 お問い合わせ
EXWM-1916 2-ヒドロキシエチルホスホネートメチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.308 お問い合わせ
EXWM-1915 8-デメチル-8-(2,3-ジメトキシ-α-L-ラハムノシル)テトラセノマイシン-C 4'-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.307 お問い合わせ
EXWM-1914 8-デメチル-8-(2-メトキシ-α-L-ラムノシル)テトラセノマイシン-C 3'-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.306 お問い合わせ
EXWM-1913 8-デメチル-8-α-L-ラムノシルテトラセノマイシン-C 2'-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.305 お問い合わせ
EXWM-1912 L-チロシン C3-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.304 お問い合わせ
EXWM-1911 2,7-ジヒドロキシ-5-メチル-1-ナフタエート 7-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.303 お問い合わせ
EXWM-1910 3-ヒドロキシ-5-メチル-1-ナフタエート 3-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.302 お問い合わせ
EXWM-1909 シペミシンN末端メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.301 お問い合わせ
EXWM-1908 パビン N-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.300 お問い合わせ
EXWM-1907 thetin-homocysteine S-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.3 9029-76-9 お問い合わせ
EXWM-1906 プロテインN末端モノメチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.299 お問い合わせ
EXWM-1905 リボソームタンパク質L3 N5-グルタミンメチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.298 お問い合わせ
EXWM-1904 ペプチド鎖放出因子 N5-グルタミンメチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.297 お問い合わせ
EXWM-1903 メチルトランスフェラーゼ cap2 EC 2.1.1.296 お問い合わせ
EXWM-1902 2-メチル-6-フィチル-1,4-ヒドロキノンメチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.295 お問い合わせ
EXWM-1901 3-O-リン酸ポリマンノシル GlcNAc-二リン酸-二トランス、オクタカシス-ウデカプレノール 3-リン酸-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.294 お問い合わせ
EXWM-1900 6-ヒドロキシトリプロスタチンB O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.293 お問い合わせ
EXWM-1899 カルミノマイシン 4-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.292 お問い合わせ
EXWM-1898 (R,S)-レチクリン 7-O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.291 お問い合わせ
EXWM-1897 tRNAPhe [7-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)ワイオシン37-O]-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.290 お問い合わせ
EXWM-1896 コバルト-プレコリン-7 (C5)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.289 お問い合わせ
EXWM-1895 アクランオニック酸メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.288 お問い合わせ
EXWM-1894 25S rRNA (アデニン645-N1)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.287 お問い合わせ
EXWM-1893 25S rRNA (アデニン2142-N1)-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.286 お問い合わせ
EXWM-1892 デメチルデカーバモイルノボビオシン O-メチルトランスフェラーゼ EC 2.1.1.285 お問い合わせ
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