NKF4（新しいキナーゼファミリー4）は、Ser/Thrキナーゼ（STK）ファミリーのメンバーであり、ヒトキノームでは「その他」グループに分類されます。NKF4ファミリーには、アミノ酸キナーゼ35遺伝子コーディングから構成されるヒトタンパク質STK35L1が主に含まれています。STK35L1が骨肉腫細胞で2つのタンパク質と共に過剰発現することを示す研究によると、STK35はCLP36と関連しているため、STK35L1はClik1（CLP36相互作用キナーゼ1）と名付けられました。Valleniusらによって記述されたClik1遺伝子は、501アミノ酸のタンパク質をコーディングしています。その後、GoyalらによってSTK35遺伝子のコーディング配列が不完全であることが発見されました。新たに同定されたSTK35遺伝子配列は、N末端に133アミノ酸の拡張を持つ534アミノ酸のタンパク質をコーディングしています。これはSTK35L1として指定されています。

導入

タンパク質キナーゼは真核細胞におけるシグナル伝達を媒介し、転写、翻訳、細胞周期プロセス、細胞骨格の再配置、移動、アポトーシス、分化など、すべての細胞プロセスの調節に関与しています。セリン/スレオニン（Ser/Thr）またはチロシン（Tyr）残基をリン酸化する真核タンパク質キナーゼは、最大の酵素スーパーファミリーであり、すべてのヒト遺伝子の約1.7%を占めています。ヒトゲノム配列の最初のドラフトが完成して以来、さまざまなグループが分析に使用された方法とデータセットに基づいて、ヒトキナーゼの数を448、510、518と推定しています。ほとんどのタンパク質キナーゼの調節ドメインは、キナーゼドメインのC末端とN末端に位置しています。異なる基質特異性にもかかわらず、Ser/Thr-およびTyr-キナーゼのキナーゼドメインは高度に保存されており、合計約275アミノ酸の長さの2つの葉から構成されています。触媒ドメインは、11のサブドメインを定義し、キナーゼドメインの触媒コアの重要な要素として機能する一連の短い配列モチーフによって特徴付けられます。これらのモチーフは、全体の触媒ドメイン配列と組み合わせて、配列アライメントや隠れマルコフモデル検索などのさまざまな方法によってゲノム内のタンパク質キナーゼをコーディングする遺伝子を特定するために使用できます。この分析と対応するcDNA配列情報は、異なるゲノムにおけるタンパク質キナーゼの数を予測することができます。ヒトキノームには、基質と生物学的機能が不明な100以上の未同定のキナーゼがあります。STK35とそのホモログPDIK1L（PDLIM1（CLP36）相互作用キナーゼ1に類似）は、キナーゼドメインにおいて69%のタンパク質配列同一性を共有しています。

新しいキナーゼファミリー4（NKF4）

彼らはNKF4（新しいキナーゼファミリー4）Ser/Thrキナーゼ（STK）ファミリーのメンバーであり、ヒトキノームでは「その他」グループに分類されています。Kinomerデータベースでは、STK35キナーゼ配列の最良の一致はTKLグループにありました。ある研究によると、骨肉腫細胞で2つのタンパク質が過剰発現した後、STK35とCLP36の間に関連があるため、STK35はClik1（CLP36相互作用キナーゼ1）としても知られています。CLP36はα-アクチン結合タンパク質で、LIMドメインとPDZドメインを含み、主にストレスファイバーに位置しています。したがって、STK35がアクチン細胞骨格の調節において果たす可能性のある機能が提案されました。STK35の生物学的機能と基質は不明です。STK35遺伝子は大腸癌で特に上方調節されていることがわかりました。パーキンソン病の齧歯類モデルでは、STK35遺伝子の発現が変化しました。ゲノム全体のRNAiスクリーニングにより、STK35のサイレンシングがPlasmodium bergheiスポロゾイトによる肝細胞感染の減少をもたらす最初の5つのヒットであることが明らかになりました。これらの研究は、STK35がさまざまなヒト疾患において役割を果たす可能性があり、生物学および医学の分野の科学者からの即時の注目に値することを示しています。

機能

STK35L1は主に核および核小体に存在します。核アクチンはSTK35L1の新しい結合パートナーとして同定されました。しかし、STK35L1は細胞質でPDLIM1/CLP-36と相互作用し、アクチンストレスファイバーに局在することができます。STK35L1はCDKN2Aの発現を調節し、G1からS期への移行を抑制します。siRNAによるSTK35L1の消費は内皮細胞の移動を損ないます。STK35L1は細胞周期と内皮細胞の移動を結びつける中心的なキナーゼとして機能することができます。

参考文献

1. Pankaj Goyal; et al. Identifying and Characterizing a Novel Protein Kinase STK35L1 and Deciphering Its Orthologs and Close-Homologs in Vertebrates. PLoS One. 2009; 4(9): e6981.