NKF4（new kinase family 4、新規キナーゼファミリー4）は、Ser/Thrキナーゼ（STK）ファミリーのメンバーであり、ヒトキノームにおいて「その他」グループに分類されています。NKF4ファミリーには主にSTK35L1が含まれており、これはアミノ酸キナーゼ35遺伝子によってコードされるヒトタンパク質です。STK35L1が骨肉腫細胞で2つのタンパク質とともに過剰発現していることを示す研究によると、STK35はCLP36と関連しているため、STK35L1はClik1（CLP36インタラクションキナーゼ1）と命名されました。Valleniusらによって記載されたClik1遺伝子は、501アミノ酸からなるタンパク質をコードしています。その後、GoyalらはSTK35遺伝子のコード配列が不完全であることを発見しました。新たに同定されたSTK35遺伝子配列は、N末端に133アミノ酸の延長を持つ534アミノ酸からなるタンパク質をコードしており、STK35L1と命名されています。

イントロダクション

プロテインキナーゼは真核細胞におけるシグナル伝達を媒介し、転写、翻訳、細胞周期過程、細胞骨格再編成、移動、アポトーシス、分化など、すべての細胞プロセスの調節に関与しています。セリン/スレオニン（Ser/Thr）またはチロシン（Tyr）残基をリン酸化する真核生物プロテインキナーゼは、最大の酵素スーパーファミリーであり、全ヒト遺伝子の約1.7%を占めます。ヒトゲノム配列の最初のドラフトが完成して以来、さまざまなグループが解析に用いた手法やデータセットに基づき、ヒトキナーゼの数を448、510、518と推定しています。ほとんどのプロテインキナーゼの調節ドメインは、キナーゼドメインのC末端およびN末端に位置しています。基質特異性は異なるものの、Ser/ThrキナーゼおよびTyrキナーゼのキナーゼドメインは高度に保存されており、全長約275アミノ酸の2つのリーフから構成されています。触媒ドメインは、11のサブドメインを定義する一連の短い配列モチーフによって特徴付けられ、キナーゼドメインの触媒コアの主要な要素となっています。これらのモチーフと全体の触媒ドメイン配列を組み合わせることで、配列アラインメントやhidden Markov model searchなどのさまざまな手法により、ゲノム中のプロテインキナーゼをコードする遺伝子を同定することができます。この解析および対応するcDNA配列情報により、さまざまなゲノムにおけるプロテインキナーゼの数を予測できます。ヒトキノームには、基質や生物学的機能が不明な100以上の未同定キナーゼが存在します。STK35およびそのホモログであるPDIK1L（PDLIM1（CLP36）インタラクションキナーゼ1に類似）は、キナーゼドメインにおいて69%のタンパク質配列同一性を共有しています。

新規キナーゼファミリー4（NKF4）

これらはNKF4（new kinase family 4、新規キナーゼファミリー4）Ser/Thrキナーゼ（STK）ファミリーのメンバーであり、ヒトキノームにおいて「その他」グループに分類されています。Kinomerデータベースにおいて、STK35キナーゼ配列の最良の一致はTKLグループにありました。ある研究によると、骨肉腫細胞で2つのタンパク質が過剰発現した後、STK35とCLP36の間に関連が認められたため、STK35はClik1（CLP36インタラクションキナーゼ1）とも呼ばれています。CLP36はα-アクチン結合タンパク質であり、LIMドメインとPDZドメインを含み、主にストレスファイバー上に局在しています。したがって、STK35がアクチン細胞骨格の調節に関与する可能性が提案されています。STK35の生物学的機能および基質は不明です。STK35遺伝子は大腸癌で特に発現が上昇していることが判明しています。パーキンソン病のげっ歯類モデルでは、STK35遺伝子の発現が変化しています。ゲノムワイドRNAiスクリーニングにより、STK35のサイレンシングはPlasmodium bergheiスポロゾイトによる肝細胞感染の減少をもたらす最初の5つのヒットの1つであることが明らかになりました。これらの研究は、STK35がさまざまなヒト疾患に関与している可能性を示しており、生物学および医学分野の科学者による早急な注目に値します。

機能

STK35L1は主に核および核小体に存在します。核アクチンはSTK35L1の新規結合パートナーとして同定されました。しかし、細胞質ではPDLIM1/CLP-36と相互作用し、アクチンストレスファイバーに局在することができます。STK35L1はCDKN2Aの発現を調節し、G1からS期への移行を抑制します。siRNAによるSTK35L1の消費は、内皮細胞の移動を障害します。STK35L1は、細胞周期と内皮細胞の移動をつなぐ中心的なキナーゼとして機能する可能性があります。

参考文献

1. Pankaj Goyal; 他。新規プロテインキナーゼSTK35L1の同定と特徴付け、および脊椎動物におけるそのオルソログと近縁ホモログの解読。 PLoS One. 2009年; 4(9): e6981.